Dans le Tokyo d'aujourd'hui, la société vit dans la crainte des goules : des créatures qui ressemblent exactement aux humains, mais qui ont une faim insatiable de leur chair. Tout cela n'a pas d'importance pour Ken Kaneki, un garçon ordinaire et studieux, jusqu'à ce qu'une rencontre sombre et violente le transforme en le premier métis humain-goule. Piégé entre deux mondes, Ken doit survivre aux violents conflits entre les factions de goules qui s'affrontent, tout en essayant d'en savoir plus sur ses pouvoirs.
Kaneki Ken accepte enfin son côté goule et décide d'affronter Yamori alias Jason.Tandis que les membres de l'Antique se mêlent parmi Aogiri afin de délivrer le jeune homme, Tôka croise à nouveau le chemin de son petit frère, Ayato et décide de le combattre. Gêné par les inspecteurs du CCG, Yoshimura décide de les retarder en participant au combat.La vérité sur la mystérieuse goule nommée "la Chouette" va être dévoilée !
Deux ans après les événements qui ont impliqué les goules du 20ème et le CCG, on suit Haise Sasaki, un inspecteur du CCG et son équipe, assignés pour traquer une goule sans scrupule qui se fait passer pour un chauffeur de taxi. Si on fait appel à eux pour ce cas, c'est parce qu'ils possèdent des caractéristiques bien précises...
Le CCG localise le quartier général d'Aogiri Tree. L'exécution de Hinami est programmée. L'éditeur de Takatsuki est interrogé sur le fait qu'il s'agisse ou non d'une goule. Mais avant d'être interrogée, Takatsuki fait une annonce publique étonnante.